Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8I0

SAMD12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD12Q8N8I0 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SAMD12Q8N8I0 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SAMD12Q8N8I0 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SAMD12Q8N8I0 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SAMD12Q8N8I0 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SAMD12Q8N8I0 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SAMD12Q8N8I0 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SAMD12Q8N8I0 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SAMD12Q8N8I0 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SAMD12Q8N8I0 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SAMD12Q8N8I0 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SAMD12Q8N8I0 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SAMD12Q8N8I0 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SAMD12Q8N8I0 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
SAMD12Q8N8I0 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SAMD12Q8N8I0 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SAMD12Q8N8I0 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SAMD12Q8N8I0 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SAMD12Q8N8I0 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SAMD12Q8N8I0 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SAMD12Q8N8I0 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SAMD12Q8N8I0 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SAMD12Q8N8I0 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SAMD12Q8N8I0 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SAMD12Q8N8I0 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SAMD12Q8N8I0 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SAMD12Q8N8I0 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SAMD12Q8N8I0 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SAMD12Q8N8I0 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SAMD12Q8N8I0 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
SAMD12Q8N8I0 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SAMD12Q8N8I0 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SAMD12Q8N8I0 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SAMD12Q8N8I0 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SAMD12Q8N8I0 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SAMD12Q8N8I0 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SAMD12Q8N8I0 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SAMD12Q8N8I0 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SAMD12Q8N8I0 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SAMD12Q8N8I0 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SAMD12Q8N8I0 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SAMD12Q8N8I0 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SAMD12Q8N8I0 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SAMD12Q8N8I0 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SAMD12Q8N8I0 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SAMD12Q8N8I0 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SAMD12Q8N8I0 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SAMD12Q8N8I0 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SAMD12Q8N8I0 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SAMD12Q8N8I0 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SAMD12Q8N8I0 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SAMD12Q8N8I0 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SAMD12Q8N8I0 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
SAMD12Q8N8I0 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SAMD12Q8N8I0 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SAMD12Q8N8I0 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SAMD12Q8N8I0 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SAMD12Q8N8I0 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
SAMD12Q8N8I0 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SAMD12Q8N8I0 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SAMD12Q8N8I0 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SAMD12Q8N8I0 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SAMD12Q8N8I0 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SAMD12Q8N8I0 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SAMD12Q8N8I0 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SAMD12Q8N8I0 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SAMD12Q8N8I0 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SAMD12Q8N8I0 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SAMD12Q8N8I0 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SAMD12Q8N8I0 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SAMD12Q8N8I0 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SAMD12Q8N8I0 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SAMD12Q8N8I0 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SAMD12Q8N8I0 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SAMD12Q8N8I0 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SAMD12Q8N8I0 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SAMD12Q8N8I0 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SAMD12Q8N8I0 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SAMD12Q8N8I0 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SAMD12Q8N8I0 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SAMD12Q8N8I0 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SAMD12Q8N8I0 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SAMD12Q8N8I0 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SAMD12Q8N8I0 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SAMD12Q8N8I0 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SAMD12Q8N8I0 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SAMD12Q8N8I0 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SAMD12Q8N8I0 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SAMD12Q8N8I0 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SAMD12Q8N8I0 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SAMD12Q8N8I0 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SAMD12Q8N8I0 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SAMD12Q8N8I0 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SAMD12Q8N8I0 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SAMD12Q8N8I0 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SAMD12Q8N8I0 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SAMD12Q8N8I0 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SAMD12Q8N8I0 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SAMD12Q8N8I0 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SAMD12Q8N8I0 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms