Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LMNTD2Q8IXW0 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
LMNTD2Q8IXW0 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms