Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV08

PLD3, Phospholipase D3, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD3Q8IV08 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PLD3Q8IV08 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PLD3Q8IV08 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PLD3Q8IV08 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PLD3Q8IV08 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PLD3Q8IV08 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PLD3Q8IV08 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PLD3Q8IV08 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PLD3Q8IV08 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PLD3Q8IV08 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PLD3Q8IV08 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PLD3Q8IV08 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PLD3Q8IV08 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PLD3Q8IV08 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PLD3Q8IV08 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PLD3Q8IV08 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PLD3Q8IV08 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PLD3Q8IV08 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PLD3Q8IV08 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PLD3Q8IV08 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PLD3Q8IV08 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PLD3Q8IV08 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PLD3Q8IV08 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PLD3Q8IV08 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PLD3Q8IV08 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PLD3Q8IV08 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PLD3Q8IV08 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PLD3Q8IV08 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PLD3Q8IV08 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PLD3Q8IV08 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PLD3Q8IV08 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PLD3Q8IV08 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PLD3Q8IV08 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PLD3Q8IV08 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PLD3Q8IV08 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PLD3Q8IV08 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PLD3Q8IV08 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PLD3Q8IV08 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PLD3Q8IV08 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PLD3Q8IV08 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PLD3Q8IV08 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PLD3Q8IV08 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PLD3Q8IV08 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PLD3Q8IV08 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PLD3Q8IV08 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PLD3Q8IV08 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PLD3Q8IV08 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PLD3Q8IV08 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PLD3Q8IV08 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PLD3Q8IV08 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PLD3Q8IV08 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PLD3Q8IV08 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PLD3Q8IV08 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PLD3Q8IV08 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PLD3Q8IV08 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PLD3Q8IV08 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PLD3Q8IV08 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PLD3Q8IV08 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PLD3Q8IV08 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PLD3Q8IV08 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PLD3Q8IV08 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PLD3Q8IV08 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PLD3Q8IV08 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PLD3Q8IV08 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PLD3Q8IV08 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PLD3Q8IV08 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PLD3Q8IV08 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PLD3Q8IV08 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PLD3Q8IV08 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PLD3Q8IV08 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PLD3Q8IV08 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PLD3Q8IV08 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PLD3Q8IV08 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PLD3Q8IV08 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PLD3Q8IV08 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PLD3Q8IV08 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PLD3Q8IV08 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PLD3Q8IV08 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PLD3Q8IV08 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PLD3Q8IV08 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PLD3Q8IV08 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PLD3Q8IV08 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PLD3Q8IV08 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PLD3Q8IV08 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PLD3Q8IV08 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PLD3Q8IV08 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PLD3Q8IV08 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PLD3Q8IV08 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PLD3Q8IV08 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PLD3Q8IV08 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PLD3Q8IV08 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PLD3Q8IV08 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PLD3Q8IV08 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PLD3Q8IV08 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PLD3Q8IV08 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PLD3Q8IV08 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PLD3Q8IV08 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PLD3Q8IV08 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PLD3Q8IV08 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PLD3Q8IV08 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms