Protein–RNA interactions for Protein: Q86VQ3

TXNDC2, Thioredoxin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC2Q86VQ3 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TXNDC2Q86VQ3 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TXNDC2Q86VQ3 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TXNDC2Q86VQ3 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TXNDC2Q86VQ3 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TXNDC2Q86VQ3 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TXNDC2Q86VQ3 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TXNDC2Q86VQ3 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TXNDC2Q86VQ3 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TXNDC2Q86VQ3 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TXNDC2Q86VQ3 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TXNDC2Q86VQ3 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TXNDC2Q86VQ3 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TXNDC2Q86VQ3 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TXNDC2Q86VQ3 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TXNDC2Q86VQ3 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TXNDC2Q86VQ3 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TXNDC2Q86VQ3 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TXNDC2Q86VQ3 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TXNDC2Q86VQ3 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TXNDC2Q86VQ3 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TXNDC2Q86VQ3 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TXNDC2Q86VQ3 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TXNDC2Q86VQ3 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TXNDC2Q86VQ3 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TXNDC2Q86VQ3 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TXNDC2Q86VQ3 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TXNDC2Q86VQ3 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TXNDC2Q86VQ3 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TXNDC2Q86VQ3 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TXNDC2Q86VQ3 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TXNDC2Q86VQ3 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TXNDC2Q86VQ3 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TXNDC2Q86VQ3 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TXNDC2Q86VQ3 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TXNDC2Q86VQ3 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TXNDC2Q86VQ3 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TXNDC2Q86VQ3 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TXNDC2Q86VQ3 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TXNDC2Q86VQ3 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TXNDC2Q86VQ3 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TXNDC2Q86VQ3 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TXNDC2Q86VQ3 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TXNDC2Q86VQ3 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TXNDC2Q86VQ3 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TXNDC2Q86VQ3 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TXNDC2Q86VQ3 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TXNDC2Q86VQ3 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TXNDC2Q86VQ3 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TXNDC2Q86VQ3 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TXNDC2Q86VQ3 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TXNDC2Q86VQ3 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TXNDC2Q86VQ3 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TXNDC2Q86VQ3 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TXNDC2Q86VQ3 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TXNDC2Q86VQ3 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TXNDC2Q86VQ3 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TXNDC2Q86VQ3 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TXNDC2Q86VQ3 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TXNDC2Q86VQ3 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TXNDC2Q86VQ3 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TXNDC2Q86VQ3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TXNDC2Q86VQ3 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TXNDC2Q86VQ3 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TXNDC2Q86VQ3 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TXNDC2Q86VQ3 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TXNDC2Q86VQ3 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TXNDC2Q86VQ3 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TXNDC2Q86VQ3 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TXNDC2Q86VQ3 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TXNDC2Q86VQ3 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TXNDC2Q86VQ3 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TXNDC2Q86VQ3 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TXNDC2Q86VQ3 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TXNDC2Q86VQ3 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TXNDC2Q86VQ3 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TXNDC2Q86VQ3 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TXNDC2Q86VQ3 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TXNDC2Q86VQ3 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TXNDC2Q86VQ3 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TXNDC2Q86VQ3 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TXNDC2Q86VQ3 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TXNDC2Q86VQ3 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TXNDC2Q86VQ3 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TXNDC2Q86VQ3 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TXNDC2Q86VQ3 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TXNDC2Q86VQ3 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TXNDC2Q86VQ3 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TXNDC2Q86VQ3 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TXNDC2Q86VQ3 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TXNDC2Q86VQ3 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TXNDC2Q86VQ3 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TXNDC2Q86VQ3 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TXNDC2Q86VQ3 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TXNDC2Q86VQ3 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TXNDC2Q86VQ3 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TXNDC2Q86VQ3 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TXNDC2Q86VQ3 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TXNDC2Q86VQ3 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TXNDC2Q86VQ3 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms