Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CCDC80Q76M96 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC80Q76M96 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms