Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LETMD1Q6P1Q0 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms