Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TRNP1Q6NT89 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TRNP1Q6NT89 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.4 ms