Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTL7

FNDC7, Fibronectin type III domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC7Q5VTL7 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FNDC7Q5VTL7 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FNDC7Q5VTL7 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FNDC7Q5VTL7 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FNDC7Q5VTL7 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FNDC7Q5VTL7 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FNDC7Q5VTL7 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FNDC7Q5VTL7 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FNDC7Q5VTL7 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FNDC7Q5VTL7 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FNDC7Q5VTL7 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FNDC7Q5VTL7 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FNDC7Q5VTL7 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FNDC7Q5VTL7 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FNDC7Q5VTL7 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FNDC7Q5VTL7 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNDC7Q5VTL7 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNDC7Q5VTL7 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNDC7Q5VTL7 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNDC7Q5VTL7 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNDC7Q5VTL7 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNDC7Q5VTL7 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNDC7Q5VTL7 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNDC7Q5VTL7 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNDC7Q5VTL7 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
FNDC7Q5VTL7 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNDC7Q5VTL7 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNDC7Q5VTL7 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNDC7Q5VTL7 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNDC7Q5VTL7 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNDC7Q5VTL7 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNDC7Q5VTL7 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNDC7Q5VTL7 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNDC7Q5VTL7 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNDC7Q5VTL7 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNDC7Q5VTL7 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNDC7Q5VTL7 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNDC7Q5VTL7 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
FNDC7Q5VTL7 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNDC7Q5VTL7 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNDC7Q5VTL7 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNDC7Q5VTL7 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
FNDC7Q5VTL7 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNDC7Q5VTL7 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNDC7Q5VTL7 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNDC7Q5VTL7 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNDC7Q5VTL7 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNDC7Q5VTL7 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
FNDC7Q5VTL7 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNDC7Q5VTL7 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNDC7Q5VTL7 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNDC7Q5VTL7 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNDC7Q5VTL7 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNDC7Q5VTL7 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNDC7Q5VTL7 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNDC7Q5VTL7 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNDC7Q5VTL7 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
FNDC7Q5VTL7 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNDC7Q5VTL7 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNDC7Q5VTL7 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNDC7Q5VTL7 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNDC7Q5VTL7 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNDC7Q5VTL7 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNDC7Q5VTL7 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNDC7Q5VTL7 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNDC7Q5VTL7 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNDC7Q5VTL7 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNDC7Q5VTL7 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNDC7Q5VTL7 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNDC7Q5VTL7 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNDC7Q5VTL7 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNDC7Q5VTL7 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNDC7Q5VTL7 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNDC7Q5VTL7 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNDC7Q5VTL7 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNDC7Q5VTL7 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNDC7Q5VTL7 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FNDC7Q5VTL7 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNDC7Q5VTL7 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNDC7Q5VTL7 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNDC7Q5VTL7 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNDC7Q5VTL7 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNDC7Q5VTL7 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FNDC7Q5VTL7 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNDC7Q5VTL7 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
FNDC7Q5VTL7 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNDC7Q5VTL7 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNDC7Q5VTL7 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNDC7Q5VTL7 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNDC7Q5VTL7 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNDC7Q5VTL7 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNDC7Q5VTL7 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNDC7Q5VTL7 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
FNDC7Q5VTL7 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNDC7Q5VTL7 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNDC7Q5VTL7 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNDC7Q5VTL7 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNDC7Q5VTL7 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNDC7Q5VTL7 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FNDC7Q5VTL7 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms