Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
FRMPD1Q5SYB0 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FRMPD1Q5SYB0 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FRMPD1Q5SYB0 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FRMPD1Q5SYB0 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
FRMPD1Q5SYB0 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
FRMPD1Q5SYB0 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
FRMPD1Q5SYB0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FRMPD1Q5SYB0 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FRMPD1Q5SYB0 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FRMPD1Q5SYB0 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FRMPD1Q5SYB0 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FRMPD1Q5SYB0 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
FRMPD1Q5SYB0 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FRMPD1Q5SYB0 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
FRMPD1Q5SYB0 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FRMPD1Q5SYB0 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FRMPD1Q5SYB0 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FRMPD1Q5SYB0 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
FRMPD1Q5SYB0 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FRMPD1Q5SYB0 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FRMPD1Q5SYB0 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FRMPD1Q5SYB0 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FRMPD1Q5SYB0 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FRMPD1Q5SYB0 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FRMPD1Q5SYB0 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FRMPD1Q5SYB0 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FRMPD1Q5SYB0 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FRMPD1Q5SYB0 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FRMPD1Q5SYB0 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
FRMPD1Q5SYB0 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FRMPD1Q5SYB0 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
FRMPD1Q5SYB0 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FRMPD1Q5SYB0 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FRMPD1Q5SYB0 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FRMPD1Q5SYB0 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FRMPD1Q5SYB0 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FRMPD1Q5SYB0 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FRMPD1Q5SYB0 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FRMPD1Q5SYB0 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FRMPD1Q5SYB0 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FRMPD1Q5SYB0 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FRMPD1Q5SYB0 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FRMPD1Q5SYB0 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FRMPD1Q5SYB0 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FRMPD1Q5SYB0 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FRMPD1Q5SYB0 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FRMPD1Q5SYB0 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FRMPD1Q5SYB0 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FRMPD1Q5SYB0 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FRMPD1Q5SYB0 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FRMPD1Q5SYB0 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FRMPD1Q5SYB0 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FRMPD1Q5SYB0 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FRMPD1Q5SYB0 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FRMPD1Q5SYB0 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
FRMPD1Q5SYB0 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FRMPD1Q5SYB0 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FRMPD1Q5SYB0 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FRMPD1Q5SYB0 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FRMPD1Q5SYB0 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
FRMPD1Q5SYB0 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FRMPD1Q5SYB0 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FRMPD1Q5SYB0 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FRMPD1Q5SYB0 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FRMPD1Q5SYB0 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FRMPD1Q5SYB0 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FRMPD1Q5SYB0 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FRMPD1Q5SYB0 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FRMPD1Q5SYB0 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FRMPD1Q5SYB0 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FRMPD1Q5SYB0 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FRMPD1Q5SYB0 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FRMPD1Q5SYB0 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FRMPD1Q5SYB0 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FRMPD1Q5SYB0 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FRMPD1Q5SYB0 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FRMPD1Q5SYB0 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FRMPD1Q5SYB0 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FRMPD1Q5SYB0 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FRMPD1Q5SYB0 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FRMPD1Q5SYB0 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FRMPD1Q5SYB0 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FRMPD1Q5SYB0 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
FRMPD1Q5SYB0 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
FRMPD1Q5SYB0 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FRMPD1Q5SYB0 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FRMPD1Q5SYB0 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FRMPD1Q5SYB0 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FRMPD1Q5SYB0 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FRMPD1Q5SYB0 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FRMPD1Q5SYB0 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FRMPD1Q5SYB0 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FRMPD1Q5SYB0 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FRMPD1Q5SYB0 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FRMPD1Q5SYB0 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FRMPD1Q5SYB0 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
FRMPD1Q5SYB0 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FRMPD1Q5SYB0 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
FRMPD1Q5SYB0 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms