Protein–RNA interactions for Protein: Q53EU6

GPAT3, Glycerol-3-phosphate acyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAT3Q53EU6 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPAT3Q53EU6 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPAT3Q53EU6 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPAT3Q53EU6 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPAT3Q53EU6 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPAT3Q53EU6 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPAT3Q53EU6 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPAT3Q53EU6 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GPAT3Q53EU6 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPAT3Q53EU6 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPAT3Q53EU6 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPAT3Q53EU6 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPAT3Q53EU6 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPAT3Q53EU6 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPAT3Q53EU6 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPAT3Q53EU6 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GPAT3Q53EU6 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPAT3Q53EU6 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPAT3Q53EU6 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPAT3Q53EU6 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPAT3Q53EU6 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GPAT3Q53EU6 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GPAT3Q53EU6 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPAT3Q53EU6 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPAT3Q53EU6 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPAT3Q53EU6 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPAT3Q53EU6 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPAT3Q53EU6 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPAT3Q53EU6 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPAT3Q53EU6 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPAT3Q53EU6 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPAT3Q53EU6 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPAT3Q53EU6 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GPAT3Q53EU6 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPAT3Q53EU6 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPAT3Q53EU6 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPAT3Q53EU6 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPAT3Q53EU6 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPAT3Q53EU6 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPAT3Q53EU6 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPAT3Q53EU6 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GPAT3Q53EU6 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPAT3Q53EU6 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPAT3Q53EU6 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPAT3Q53EU6 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPAT3Q53EU6 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPAT3Q53EU6 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPAT3Q53EU6 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPAT3Q53EU6 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPAT3Q53EU6 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GPAT3Q53EU6 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GPAT3Q53EU6 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPAT3Q53EU6 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPAT3Q53EU6 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPAT3Q53EU6 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPAT3Q53EU6 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPAT3Q53EU6 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPAT3Q53EU6 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPAT3Q53EU6 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPAT3Q53EU6 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPAT3Q53EU6 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPAT3Q53EU6 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPAT3Q53EU6 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPAT3Q53EU6 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPAT3Q53EU6 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPAT3Q53EU6 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPAT3Q53EU6 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPAT3Q53EU6 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPAT3Q53EU6 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPAT3Q53EU6 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPAT3Q53EU6 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPAT3Q53EU6 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPAT3Q53EU6 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPAT3Q53EU6 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GPAT3Q53EU6 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPAT3Q53EU6 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPAT3Q53EU6 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPAT3Q53EU6 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPAT3Q53EU6 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GPAT3Q53EU6 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPAT3Q53EU6 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPAT3Q53EU6 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPAT3Q53EU6 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPAT3Q53EU6 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GPAT3Q53EU6 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPAT3Q53EU6 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPAT3Q53EU6 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GPAT3Q53EU6 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GPAT3Q53EU6 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GPAT3Q53EU6 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GPAT3Q53EU6 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GPAT3Q53EU6 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GPAT3Q53EU6 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GPAT3Q53EU6 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GPAT3Q53EU6 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GPAT3Q53EU6 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GPAT3Q53EU6 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GPAT3Q53EU6 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GPAT3Q53EU6 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GPAT3Q53EU6 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms