Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNV8

PCGF3, Polycomb group RING finger protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF3Q3KNV8 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PCGF3Q3KNV8 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PCGF3Q3KNV8 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PCGF3Q3KNV8 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PCGF3Q3KNV8 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PCGF3Q3KNV8 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PCGF3Q3KNV8 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PCGF3Q3KNV8 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PCGF3Q3KNV8 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PCGF3Q3KNV8 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PCGF3Q3KNV8 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCGF3Q3KNV8 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCGF3Q3KNV8 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCGF3Q3KNV8 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCGF3Q3KNV8 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCGF3Q3KNV8 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCGF3Q3KNV8 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCGF3Q3KNV8 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCGF3Q3KNV8 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCGF3Q3KNV8 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCGF3Q3KNV8 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCGF3Q3KNV8 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCGF3Q3KNV8 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PCGF3Q3KNV8 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms