Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KLHL38Q2WGJ6 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KLHL38Q2WGJ6 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms