Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
KLHL40Q2TBA0 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
KLHL40Q2TBA0 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
KLHL40Q2TBA0 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
KLHL40Q2TBA0 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
KLHL40Q2TBA0 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
KLHL40Q2TBA0 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
KLHL40Q2TBA0 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
KLHL40Q2TBA0 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
KLHL40Q2TBA0 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
KLHL40Q2TBA0 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
KLHL40Q2TBA0 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
KLHL40Q2TBA0 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
KLHL40Q2TBA0 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
KLHL40Q2TBA0 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
KLHL40Q2TBA0 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
KLHL40Q2TBA0 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
KLHL40Q2TBA0 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
KLHL40Q2TBA0 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
KLHL40Q2TBA0 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
KLHL40Q2TBA0 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
KLHL40Q2TBA0 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
KLHL40Q2TBA0 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
KLHL40Q2TBA0 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
KLHL40Q2TBA0 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
KLHL40Q2TBA0 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
KLHL40Q2TBA0 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
KLHL40Q2TBA0 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
KLHL40Q2TBA0 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
KLHL40Q2TBA0 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
KLHL40Q2TBA0 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
KLHL40Q2TBA0 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
KLHL40Q2TBA0 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
KLHL40Q2TBA0 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
KLHL40Q2TBA0 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
KLHL40Q2TBA0 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
KLHL40Q2TBA0 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
KLHL40Q2TBA0 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
KLHL40Q2TBA0 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
KLHL40Q2TBA0 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
KLHL40Q2TBA0 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
KLHL40Q2TBA0 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
KLHL40Q2TBA0 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
KLHL40Q2TBA0 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
KLHL40Q2TBA0 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
KLHL40Q2TBA0 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
KLHL40Q2TBA0 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
KLHL40Q2TBA0 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
KLHL40Q2TBA0 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
KLHL40Q2TBA0 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
KLHL40Q2TBA0 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
KLHL40Q2TBA0 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
KLHL40Q2TBA0 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
KLHL40Q2TBA0 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
KLHL40Q2TBA0 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
KLHL40Q2TBA0 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
KLHL40Q2TBA0 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
KLHL40Q2TBA0 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
KLHL40Q2TBA0 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
KLHL40Q2TBA0 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
KLHL40Q2TBA0 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
KLHL40Q2TBA0 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
KLHL40Q2TBA0 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
KLHL40Q2TBA0 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
KLHL40Q2TBA0 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
KLHL40Q2TBA0 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLHL40Q2TBA0 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLHL40Q2TBA0 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLHL40Q2TBA0 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLHL40Q2TBA0 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLHL40Q2TBA0 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLHL40Q2TBA0 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLHL40Q2TBA0 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLHL40Q2TBA0 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLHL40Q2TBA0 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLHL40Q2TBA0 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLHL40Q2TBA0 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
KLHL40Q2TBA0 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLHL40Q2TBA0 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLHL40Q2TBA0 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLHL40Q2TBA0 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLHL40Q2TBA0 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
KLHL40Q2TBA0 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLHL40Q2TBA0 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLHL40Q2TBA0 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLHL40Q2TBA0 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLHL40Q2TBA0 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLHL40Q2TBA0 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLHL40Q2TBA0 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLHL40Q2TBA0 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLHL40Q2TBA0 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLHL40Q2TBA0 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLHL40Q2TBA0 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLHL40Q2TBA0 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLHL40Q2TBA0 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLHL40Q2TBA0 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
KLHL40Q2TBA0 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
KLHL40Q2TBA0 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms