Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAC2

CCDC57, Coiled-coil domain-containing protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC57Q2TAC2 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC57Q2TAC2 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC57Q2TAC2 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms