Protein–RNA interactions for Protein: Q1T7F1

Putative chemokine-related protein B42, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q1T7F1 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Q1T7F1 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Q1T7F1 GULP1-207ENST00000409843 2643 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.95
Q1T7F1 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC9.15□□□□□ -0.95
Q1T7F1 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Q1T7F1 FTO-214ENST00000636218 2227 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
Q1T7F1 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Q1T7F1 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.95
Q1T7F1 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
Q1T7F1 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
Q1T7F1 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.95
Q1T7F1 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.95
Q1T7F1 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Q1T7F1 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Q1T7F1 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Q1T7F1 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Q1T7F1 MCC-201ENST00000302475 8257 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Q1T7F1 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Q1T7F1 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Q1T7F1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Q1T7F1 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Q1T7F1 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Q1T7F1 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Q1T7F1 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Q1T7F1 MKLN1-203ENST00000421797 2460 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Q1T7F1 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Q1T7F1 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Q1T7F1 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Q1T7F1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Q1T7F1 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Q1T7F1 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Q1T7F1 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Q1T7F1 HSD17B4-201ENST00000256216 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Q1T7F1 TJAP1-204ENST00000372449 2695 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Q1T7F1 TJAP1-205ENST00000372452 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Q1T7F1 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Q1T7F1 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Q1T7F1 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Q1T7F1 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Q1T7F1 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Q1T7F1 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Q1T7F1 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Q1T7F1 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Q1T7F1 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Q1T7F1 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Q1T7F1 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Q1T7F1 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Q1T7F1 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Q1T7F1 KIF21B-204ENST00000461742 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Q1T7F1 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Q1T7F1 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Q1T7F1 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Q1T7F1 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Q1T7F1 GJB4-201ENST00000339480 2840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Q1T7F1 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Q1T7F1 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Q1T7F1 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Q1T7F1 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Q1T7F1 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Q1T7F1 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Q1T7F1 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Q1T7F1 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Q1T7F1 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Q1T7F1 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Q1T7F1 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Q1T7F1 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Q1T7F1 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Q1T7F1 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Q1T7F1 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Q1T7F1 TBC1D3P2-203ENST00000581291 2088 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Q1T7F1 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Q1T7F1 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Q1T7F1 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Q1T7F1 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Q1T7F1 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Q1T7F1 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Q1T7F1 RPL31-207ENST00000409711 2328 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Q1T7F1 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Q1T7F1 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Q1T7F1 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Q1T7F1 BAIAP2-202ENST00000321300 2879 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Q1T7F1 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Q1T7F1 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Q1T7F1 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Q1T7F1 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Q1T7F1 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Q1T7F1 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC9.14□□□□□ -0.95
Q1T7F1 SPTSSB-201ENST00000359175 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
Q1T7F1 ELN-211ENST00000414324 3139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
Q1T7F1 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Q1T7F1 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Q1T7F1 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Q1T7F1 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Q1T7F1 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Q1T7F1 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
Q1T7F1 COL4A3-202ENST00000396578 8097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Q1T7F1 MSH2-201ENST00000233146 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Q1T7F1 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Q1T7F1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
Q1T7F1 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
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