Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
IMPG1Q17R60 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms