Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
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PDK4Q16654 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
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PDK4Q16654 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PDK4Q16654 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
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