Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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SSX1Q16384 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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SSX1Q16384 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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SSX1Q16384 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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SSX1Q16384 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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SSX1Q16384 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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SSX1Q16384 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SSX1Q16384 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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