Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NPTX1Q15818 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms