Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNHIT3Q15649 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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