Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 FTLP5-201ENST00000586853 534 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 HDAC8-204ENST00000373560 819 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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RYR3Q15413 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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RYR3Q15413 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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RYR3Q15413 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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RYR3Q15413 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
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RYR3Q15413 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
RYR3Q15413 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
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RYR3Q15413 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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RYR3Q15413 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC11.27□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC11.27□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 FAM192A-218ENST00000567439 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RYR3Q15413 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
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