Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LAPTM4AQ15012 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms