Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHPRHQ149N8 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHPRHQ149N8 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHPRHQ149N8 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHPRHQ149N8 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHPRHQ149N8 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHPRHQ149N8 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHPRHQ149N8 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHPRHQ149N8 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHPRHQ149N8 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHPRHQ149N8 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHPRHQ149N8 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SHPRHQ149N8 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SHPRHQ149N8 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SHPRHQ149N8 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SHPRHQ149N8 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SHPRHQ149N8 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SHPRHQ149N8 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SHPRHQ149N8 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SHPRHQ149N8 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SHPRHQ149N8 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SHPRHQ149N8 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SHPRHQ149N8 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SHPRHQ149N8 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SHPRHQ149N8 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SHPRHQ149N8 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SHPRHQ149N8 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SHPRHQ149N8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SHPRHQ149N8 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHPRHQ149N8 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHPRHQ149N8 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHPRHQ149N8 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHPRHQ149N8 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHPRHQ149N8 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHPRHQ149N8 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHPRHQ149N8 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHPRHQ149N8 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHPRHQ149N8 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SHPRHQ149N8 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHPRHQ149N8 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHPRHQ149N8 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHPRHQ149N8 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHPRHQ149N8 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHPRHQ149N8 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHPRHQ149N8 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHPRHQ149N8 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHPRHQ149N8 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SHPRHQ149N8 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHPRHQ149N8 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHPRHQ149N8 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHPRHQ149N8 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHPRHQ149N8 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHPRHQ149N8 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHPRHQ149N8 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHPRHQ149N8 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHPRHQ149N8 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHPRHQ149N8 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SHPRHQ149N8 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHPRHQ149N8 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SHPRHQ149N8 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHPRHQ149N8 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHPRHQ149N8 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHPRHQ149N8 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHPRHQ149N8 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHPRHQ149N8 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHPRHQ149N8 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SHPRHQ149N8 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SHPRHQ149N8 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHPRHQ149N8 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHPRHQ149N8 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHPRHQ149N8 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHPRHQ149N8 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHPRHQ149N8 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHPRHQ149N8 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHPRHQ149N8 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SHPRHQ149N8 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHPRHQ149N8 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHPRHQ149N8 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SHPRHQ149N8 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHPRHQ149N8 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHPRHQ149N8 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHPRHQ149N8 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHPRHQ149N8 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHPRHQ149N8 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHPRHQ149N8 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SHPRHQ149N8 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHPRHQ149N8 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHPRHQ149N8 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHPRHQ149N8 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHPRHQ149N8 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHPRHQ149N8 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHPRHQ149N8 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHPRHQ149N8 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHPRHQ149N8 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHPRHQ149N8 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHPRHQ149N8 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHPRHQ149N8 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHPRHQ149N8 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SHPRHQ149N8 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SHPRHQ149N8 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
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