Protein–RNA interactions for Protein: Q149M9

NWD1, NACHT domain- and WD repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NWD1Q149M9 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NWD1Q149M9 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NWD1Q149M9 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NWD1Q149M9 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NWD1Q149M9 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NWD1Q149M9 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NWD1Q149M9 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NWD1Q149M9 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NWD1Q149M9 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NWD1Q149M9 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NWD1Q149M9 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NWD1Q149M9 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NWD1Q149M9 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NWD1Q149M9 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NWD1Q149M9 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NWD1Q149M9 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NWD1Q149M9 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NWD1Q149M9 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NWD1Q149M9 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NWD1Q149M9 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NWD1Q149M9 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NWD1Q149M9 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NWD1Q149M9 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NWD1Q149M9 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NWD1Q149M9 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NWD1Q149M9 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NWD1Q149M9 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NWD1Q149M9 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NWD1Q149M9 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NWD1Q149M9 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NWD1Q149M9 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NWD1Q149M9 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NWD1Q149M9 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NWD1Q149M9 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NWD1Q149M9 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NWD1Q149M9 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NWD1Q149M9 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NWD1Q149M9 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NWD1Q149M9 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NWD1Q149M9 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NWD1Q149M9 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NWD1Q149M9 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NWD1Q149M9 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NWD1Q149M9 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NWD1Q149M9 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
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