Protein–RNA interactions for Protein: Q14153

FAM53B, Protein FAM53B, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53BQ14153 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM53BQ14153 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM53BQ14153 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM53BQ14153 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM53BQ14153 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM53BQ14153 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM53BQ14153 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM53BQ14153 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM53BQ14153 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM53BQ14153 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM53BQ14153 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM53BQ14153 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM53BQ14153 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM53BQ14153 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM53BQ14153 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM53BQ14153 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM53BQ14153 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM53BQ14153 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM53BQ14153 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM53BQ14153 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM53BQ14153 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM53BQ14153 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM53BQ14153 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM53BQ14153 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM53BQ14153 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM53BQ14153 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM53BQ14153 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM53BQ14153 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM53BQ14153 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM53BQ14153 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM53BQ14153 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM53BQ14153 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM53BQ14153 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM53BQ14153 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FAM53BQ14153 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM53BQ14153 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM53BQ14153 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM53BQ14153 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM53BQ14153 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM53BQ14153 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM53BQ14153 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM53BQ14153 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM53BQ14153 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM53BQ14153 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM53BQ14153 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM53BQ14153 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM53BQ14153 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM53BQ14153 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM53BQ14153 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM53BQ14153 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM53BQ14153 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM53BQ14153 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM53BQ14153 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM53BQ14153 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM53BQ14153 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM53BQ14153 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM53BQ14153 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM53BQ14153 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM53BQ14153 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM53BQ14153 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM53BQ14153 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM53BQ14153 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM53BQ14153 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM53BQ14153 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM53BQ14153 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM53BQ14153 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM53BQ14153 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM53BQ14153 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM53BQ14153 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FAM53BQ14153 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM53BQ14153 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM53BQ14153 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM53BQ14153 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM53BQ14153 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM53BQ14153 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM53BQ14153 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM53BQ14153 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM53BQ14153 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM53BQ14153 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM53BQ14153 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM53BQ14153 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM53BQ14153 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM53BQ14153 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM53BQ14153 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM53BQ14153 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM53BQ14153 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM53BQ14153 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM53BQ14153 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM53BQ14153 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM53BQ14153 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM53BQ14153 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM53BQ14153 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM53BQ14153 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM53BQ14153 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM53BQ14153 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM53BQ14153 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM53BQ14153 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM53BQ14153 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM53BQ14153 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
FAM53BQ14153 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms