Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CKAP5Q14008 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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