Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOFQ13790 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
APOFQ13790 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOFQ13790 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOFQ13790 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
APOFQ13790 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOFQ13790 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOFQ13790 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOFQ13790 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOFQ13790 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOFQ13790 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOFQ13790 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOFQ13790 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOFQ13790 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOFQ13790 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOFQ13790 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOFQ13790 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
APOFQ13790 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
APOFQ13790 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOFQ13790 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOFQ13790 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOFQ13790 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOFQ13790 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOFQ13790 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOFQ13790 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOFQ13790 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOFQ13790 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOFQ13790 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOFQ13790 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOFQ13790 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOFQ13790 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOFQ13790 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
APOFQ13790 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOFQ13790 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOFQ13790 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOFQ13790 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOFQ13790 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOFQ13790 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOFQ13790 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOFQ13790 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOFQ13790 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOFQ13790 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOFQ13790 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
APOFQ13790 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOFQ13790 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOFQ13790 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
APOFQ13790 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOFQ13790 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOFQ13790 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOFQ13790 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOFQ13790 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOFQ13790 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOFQ13790 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOFQ13790 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOFQ13790 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOFQ13790 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOFQ13790 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOFQ13790 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOFQ13790 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOFQ13790 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOFQ13790 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
APOFQ13790 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOFQ13790 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOFQ13790 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
APOFQ13790 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOFQ13790 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOFQ13790 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOFQ13790 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOFQ13790 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
APOFQ13790 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOFQ13790 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOFQ13790 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOFQ13790 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOFQ13790 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOFQ13790 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOFQ13790 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOFQ13790 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOFQ13790 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
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APOFQ13790 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOFQ13790 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOFQ13790 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOFQ13790 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOFQ13790 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOFQ13790 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOFQ13790 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
APOFQ13790 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOFQ13790 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOFQ13790 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOFQ13790 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOFQ13790 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
APOFQ13790 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOFQ13790 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOFQ13790 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOFQ13790 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOFQ13790 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOFQ13790 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOFQ13790 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOFQ13790 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
APOFQ13790 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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