Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
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CUL4AQ13619 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CUL4AQ13619 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
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