Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 AP003041.2-201ENST00000525666 1180 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 AC114488.3-201ENST00000581333 480 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 LYRM2-204ENST00000520441 791 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 RPL5-202ENST00000370321 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 DEFT1P-201ENST00000453425 496 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
MKRN4PQ13434 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 AC003075.1-208ENST00000415246 596 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 AL022319.1-201ENST00000458183 1167 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 RNF139-AS1-202ENST00000519861 359 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MKRN4PQ13434 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
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