Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PMS2P3Q13401 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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