Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SKP2Q13309 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms