Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
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CBX3Q13185 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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CBX3Q13185 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
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CBX3Q13185 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CBX3Q13185 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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