Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NFX1Q12986 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NFX1Q12986 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
NFX1Q12986 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
NFX1Q12986 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NFX1Q12986 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
NFX1Q12986 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
NFX1Q12986 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
NFX1Q12986 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NFX1Q12986 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NFX1Q12986 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NFX1Q12986 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
NFX1Q12986 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NFX1Q12986 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NFX1Q12986 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NFX1Q12986 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NFX1Q12986 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NFX1Q12986 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NFX1Q12986 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NFX1Q12986 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NFX1Q12986 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NFX1Q12986 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NFX1Q12986 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NFX1Q12986 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NFX1Q12986 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NFX1Q12986 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
NFX1Q12986 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
NFX1Q12986 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NFX1Q12986 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NFX1Q12986 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NFX1Q12986 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NFX1Q12986 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NFX1Q12986 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NFX1Q12986 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NFX1Q12986 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NFX1Q12986 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NFX1Q12986 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NFX1Q12986 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NFX1Q12986 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NFX1Q12986 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NFX1Q12986 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NFX1Q12986 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NFX1Q12986 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NFX1Q12986 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NFX1Q12986 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NFX1Q12986 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NFX1Q12986 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NFX1Q12986 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NFX1Q12986 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NFX1Q12986 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NFX1Q12986 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NFX1Q12986 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NFX1Q12986 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NFX1Q12986 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NFX1Q12986 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
NFX1Q12986 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NFX1Q12986 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NFX1Q12986 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
NFX1Q12986 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NFX1Q12986 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NFX1Q12986 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NFX1Q12986 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NFX1Q12986 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NFX1Q12986 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NFX1Q12986 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NFX1Q12986 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
NFX1Q12986 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NFX1Q12986 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NFX1Q12986 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NFX1Q12986 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NFX1Q12986 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NFX1Q12986 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NFX1Q12986 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
NFX1Q12986 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NFX1Q12986 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NFX1Q12986 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NFX1Q12986 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NFX1Q12986 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NFX1Q12986 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NFX1Q12986 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NFX1Q12986 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NFX1Q12986 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NFX1Q12986 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NFX1Q12986 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
NFX1Q12986 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
NFX1Q12986 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
NFX1Q12986 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NFX1Q12986 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
NFX1Q12986 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
NFX1Q12986 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NFX1Q12986 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
NFX1Q12986 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NFX1Q12986 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NFX1Q12986 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NFX1Q12986 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NFX1Q12986 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NFX1Q12986 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NFX1Q12986 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NFX1Q12986 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NFX1Q12986 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
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