Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
FOXD4Q12950 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
FOXD4Q12950 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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