Protein–RNA interactions for Protein: Q12908

SLC10A2, Ileal sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A2Q12908 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC10A2Q12908 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC10A2Q12908 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC10A2Q12908 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC10A2Q12908 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC10A2Q12908 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC10A2Q12908 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC10A2Q12908 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC10A2Q12908 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC10A2Q12908 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC10A2Q12908 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC10A2Q12908 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC10A2Q12908 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC10A2Q12908 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC10A2Q12908 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC10A2Q12908 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC10A2Q12908 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC10A2Q12908 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SLC10A2Q12908 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC10A2Q12908 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC10A2Q12908 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC10A2Q12908 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC10A2Q12908 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC10A2Q12908 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC10A2Q12908 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC10A2Q12908 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC10A2Q12908 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC10A2Q12908 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC10A2Q12908 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC10A2Q12908 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC10A2Q12908 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC10A2Q12908 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC10A2Q12908 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC10A2Q12908 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC10A2Q12908 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC10A2Q12908 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC10A2Q12908 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC10A2Q12908 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC10A2Q12908 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC10A2Q12908 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC10A2Q12908 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC10A2Q12908 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC10A2Q12908 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC10A2Q12908 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC10A2Q12908 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC10A2Q12908 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC10A2Q12908 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC10A2Q12908 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC10A2Q12908 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC10A2Q12908 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC10A2Q12908 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC10A2Q12908 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC10A2Q12908 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC10A2Q12908 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC10A2Q12908 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SLC10A2Q12908 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLC10A2Q12908 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLC10A2Q12908 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLC10A2Q12908 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLC10A2Q12908 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLC10A2Q12908 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLC10A2Q12908 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLC10A2Q12908 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SLC10A2Q12908 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC10A2Q12908 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC10A2Q12908 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC10A2Q12908 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC10A2Q12908 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC10A2Q12908 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC10A2Q12908 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC10A2Q12908 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC10A2Q12908 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC10A2Q12908 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC10A2Q12908 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC10A2Q12908 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC10A2Q12908 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC10A2Q12908 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC10A2Q12908 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC10A2Q12908 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC10A2Q12908 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC10A2Q12908 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC10A2Q12908 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC10A2Q12908 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC10A2Q12908 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SLC10A2Q12908 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC10A2Q12908 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC10A2Q12908 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC10A2Q12908 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC10A2Q12908 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC10A2Q12908 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC10A2Q12908 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC10A2Q12908 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC10A2Q12908 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC10A2Q12908 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC10A2Q12908 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC10A2Q12908 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC10A2Q12908 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC10A2Q12908 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC10A2Q12908 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SLC10A2Q12908 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms