Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NFIAQ12857 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
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