Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIPPLY1Q0D2K3 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms