Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNA1Q09470 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNA1Q09470 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNA1Q09470 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNA1Q09470 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNA1Q09470 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNA1Q09470 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNA1Q09470 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNA1Q09470 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNA1Q09470 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNA1Q09470 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNA1Q09470 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNA1Q09470 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNA1Q09470 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
KCNA1Q09470 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNA1Q09470 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNA1Q09470 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNA1Q09470 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNA1Q09470 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNA1Q09470 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNA1Q09470 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNA1Q09470 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNA1Q09470 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNA1Q09470 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNA1Q09470 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNA1Q09470 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNA1Q09470 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNA1Q09470 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNA1Q09470 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNA1Q09470 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNA1Q09470 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNA1Q09470 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNA1Q09470 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNA1Q09470 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNA1Q09470 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNA1Q09470 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNA1Q09470 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNA1Q09470 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNA1Q09470 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNA1Q09470 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNA1Q09470 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNA1Q09470 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNA1Q09470 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNA1Q09470 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNA1Q09470 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNA1Q09470 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNA1Q09470 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNA1Q09470 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNA1Q09470 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNA1Q09470 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNA1Q09470 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNA1Q09470 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNA1Q09470 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNA1Q09470 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNA1Q09470 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNA1Q09470 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
KCNA1Q09470 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNA1Q09470 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNA1Q09470 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNA1Q09470 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNA1Q09470 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNA1Q09470 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNA1Q09470 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNA1Q09470 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNA1Q09470 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNA1Q09470 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNA1Q09470 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNA1Q09470 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNA1Q09470 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNA1Q09470 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNA1Q09470 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNA1Q09470 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNA1Q09470 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNA1Q09470 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNA1Q09470 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNA1Q09470 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNA1Q09470 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNA1Q09470 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNA1Q09470 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNA1Q09470 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNA1Q09470 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNA1Q09470 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNA1Q09470 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNA1Q09470 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNA1Q09470 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNA1Q09470 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNA1Q09470 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNA1Q09470 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNA1Q09470 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNA1Q09470 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
KCNA1Q09470 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNA1Q09470 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNA1Q09470 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNA1Q09470 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNA1Q09470 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNA1Q09470 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNA1Q09470 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNA1Q09470 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNA1Q09470 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
KCNA1Q09470 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms