Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CYP4F3Q08477 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms