Protein–RNA interactions for Protein: Q07001

CHRND, Acetylcholine receptor subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNDQ07001 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHRNDQ07001 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHRNDQ07001 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CHRNDQ07001 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHRNDQ07001 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHRNDQ07001 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CHRNDQ07001 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHRNDQ07001 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHRNDQ07001 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CHRNDQ07001 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHRNDQ07001 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHRNDQ07001 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CHRNDQ07001 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CHRNDQ07001 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CHRNDQ07001 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CHRNDQ07001 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CHRNDQ07001 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CHRNDQ07001 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CHRNDQ07001 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CHRNDQ07001 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CHRNDQ07001 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CHRNDQ07001 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHRNDQ07001 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHRNDQ07001 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHRNDQ07001 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHRNDQ07001 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHRNDQ07001 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHRNDQ07001 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHRNDQ07001 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHRNDQ07001 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHRNDQ07001 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHRNDQ07001 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHRNDQ07001 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHRNDQ07001 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHRNDQ07001 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHRNDQ07001 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHRNDQ07001 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHRNDQ07001 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHRNDQ07001 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHRNDQ07001 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHRNDQ07001 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHRNDQ07001 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CHRNDQ07001 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHRNDQ07001 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHRNDQ07001 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CHRNDQ07001 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHRNDQ07001 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHRNDQ07001 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHRNDQ07001 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHRNDQ07001 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHRNDQ07001 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHRNDQ07001 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHRNDQ07001 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHRNDQ07001 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHRNDQ07001 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CHRNDQ07001 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHRNDQ07001 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHRNDQ07001 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHRNDQ07001 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHRNDQ07001 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CHRNDQ07001 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CHRNDQ07001 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHRNDQ07001 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHRNDQ07001 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHRNDQ07001 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHRNDQ07001 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHRNDQ07001 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHRNDQ07001 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHRNDQ07001 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHRNDQ07001 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHRNDQ07001 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHRNDQ07001 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHRNDQ07001 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHRNDQ07001 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHRNDQ07001 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHRNDQ07001 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHRNDQ07001 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHRNDQ07001 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHRNDQ07001 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHRNDQ07001 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHRNDQ07001 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHRNDQ07001 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHRNDQ07001 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHRNDQ07001 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHRNDQ07001 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHRNDQ07001 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHRNDQ07001 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHRNDQ07001 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHRNDQ07001 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHRNDQ07001 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHRNDQ07001 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHRNDQ07001 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHRNDQ07001 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHRNDQ07001 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHRNDQ07001 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHRNDQ07001 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHRNDQ07001 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHRNDQ07001 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHRNDQ07001 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CHRNDQ07001 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms