Protein–RNA interactions for Protein: Q00535

CDK5, Cyclin-dependent-like kinase 5, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5Q00535 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CDK5Q00535 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDK5Q00535 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms