Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ACTBP60709 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ACTBP60709 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ACTBP60709 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
ACTBP60709 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ACTBP60709 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
ACTBP60709 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ACTBP60709 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ACTBP60709 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ACTBP60709 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ACTBP60709 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ACTBP60709 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ACTBP60709 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ACTBP60709 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ACTBP60709 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ACTBP60709 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
ACTBP60709 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
ACTBP60709 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
ACTBP60709 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ACTBP60709 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ACTBP60709 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ACTBP60709 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ACTBP60709 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ACTBP60709 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ACTBP60709 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ACTBP60709 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ACTBP60709 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ACTBP60709 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ACTBP60709 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ACTBP60709 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ACTBP60709 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ACTBP60709 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ACTBP60709 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ACTBP60709 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
ACTBP60709 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ACTBP60709 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
ACTBP60709 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ACTBP60709 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ACTBP60709 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ACTBP60709 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ACTBP60709 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ACTBP60709 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ACTBP60709 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ACTBP60709 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ACTBP60709 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ACTBP60709 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ACTBP60709 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ACTBP60709 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ACTBP60709 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ACTBP60709 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ACTBP60709 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ACTBP60709 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ACTBP60709 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ACTBP60709 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ACTBP60709 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ACTBP60709 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
ACTBP60709 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
ACTBP60709 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ACTBP60709 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
ACTBP60709 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
ACTBP60709 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ACTBP60709 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ACTBP60709 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ACTBP60709 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ACTBP60709 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
ACTBP60709 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ACTBP60709 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ACTBP60709 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ACTBP60709 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
ACTBP60709 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
ACTBP60709 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ACTBP60709 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ACTBP60709 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ACTBP60709 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ACTBP60709 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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ACTBP60709 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ACTBP60709 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ACTBP60709 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ACTBP60709 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ACTBP60709 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ACTBP60709 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ACTBP60709 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ACTBP60709 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACTBP60709 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACTBP60709 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACTBP60709 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACTBP60709 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACTBP60709 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACTBP60709 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACTBP60709 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACTBP60709 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACTBP60709 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACTBP60709 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACTBP60709 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACTBP60709 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACTBP60709 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACTBP60709 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACTBP60709 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
ACTBP60709 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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