Protein–RNA interactions for Protein: P55212

CASP6, Caspase-6, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP6P55212 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP6P55212 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP6P55212 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP6P55212 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP6P55212 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP6P55212 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP6P55212 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP6P55212 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP6P55212 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP6P55212 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP6P55212 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP6P55212 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP6P55212 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP6P55212 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP6P55212 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP6P55212 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP6P55212 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP6P55212 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP6P55212 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP6P55212 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP6P55212 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP6P55212 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP6P55212 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP6P55212 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP6P55212 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP6P55212 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP6P55212 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP6P55212 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP6P55212 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP6P55212 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP6P55212 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP6P55212 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP6P55212 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP6P55212 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP6P55212 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP6P55212 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP6P55212 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP6P55212 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP6P55212 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP6P55212 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP6P55212 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP6P55212 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP6P55212 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CASP6P55212 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP6P55212 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP6P55212 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP6P55212 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP6P55212 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP6P55212 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP6P55212 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP6P55212 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP6P55212 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP6P55212 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP6P55212 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP6P55212 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP6P55212 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP6P55212 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP6P55212 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP6P55212 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP6P55212 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP6P55212 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP6P55212 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP6P55212 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP6P55212 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP6P55212 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP6P55212 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP6P55212 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP6P55212 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP6P55212 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP6P55212 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP6P55212 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP6P55212 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP6P55212 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP6P55212 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP6P55212 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP6P55212 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP6P55212 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP6P55212 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CASP6P55212 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP6P55212 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP6P55212 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP6P55212 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP6P55212 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP6P55212 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP6P55212 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP6P55212 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP6P55212 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP6P55212 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP6P55212 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP6P55212 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP6P55212 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP6P55212 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP6P55212 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP6P55212 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP6P55212 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP6P55212 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP6P55212 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP6P55212 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP6P55212 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CASP6P55212 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms