Protein–RNA interactions for Protein: P51679

CCR4, C-C chemokine receptor type 4, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR4P51679 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCR4P51679 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCR4P51679 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCR4P51679 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCR4P51679 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCR4P51679 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCR4P51679 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCR4P51679 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCR4P51679 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCR4P51679 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCR4P51679 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCR4P51679 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCR4P51679 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCR4P51679 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCR4P51679 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCR4P51679 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCR4P51679 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCR4P51679 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCR4P51679 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCR4P51679 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCR4P51679 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCR4P51679 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCR4P51679 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCR4P51679 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCR4P51679 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCR4P51679 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCR4P51679 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCR4P51679 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CCR4P51679 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCR4P51679 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CCR4P51679 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCR4P51679 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCR4P51679 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCR4P51679 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCR4P51679 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCR4P51679 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCR4P51679 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCR4P51679 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCR4P51679 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCR4P51679 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCR4P51679 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCR4P51679 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCR4P51679 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCR4P51679 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCR4P51679 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCR4P51679 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCR4P51679 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCR4P51679 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCR4P51679 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCR4P51679 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCR4P51679 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCR4P51679 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCR4P51679 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCR4P51679 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCR4P51679 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCR4P51679 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCR4P51679 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCR4P51679 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCR4P51679 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCR4P51679 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCR4P51679 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCR4P51679 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCR4P51679 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCR4P51679 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCR4P51679 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCR4P51679 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCR4P51679 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCR4P51679 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCR4P51679 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCR4P51679 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCR4P51679 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCR4P51679 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCR4P51679 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCR4P51679 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCR4P51679 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCR4P51679 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCR4P51679 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CCR4P51679 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CCR4P51679 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCR4P51679 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCR4P51679 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CCR4P51679 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCR4P51679 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCR4P51679 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCR4P51679 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCR4P51679 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCR4P51679 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCR4P51679 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCR4P51679 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCR4P51679 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCR4P51679 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
CCR4P51679 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCR4P51679 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCR4P51679 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCR4P51679 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCR4P51679 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCR4P51679 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCR4P51679 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCR4P51679 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCR4P51679 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms