Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
BRCA2P51587 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.62
BRCA2P51587 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.62
BRCA2P51587 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
BRCA2P51587 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms