Protein–RNA interactions for Protein: P51449

RORC, Nuclear receptor ROR-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORCP51449 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RORCP51449 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RORCP51449 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RORCP51449 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RORCP51449 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
RORCP51449 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RORCP51449 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RORCP51449 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RORCP51449 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RORCP51449 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RORCP51449 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RORCP51449 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RORCP51449 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RORCP51449 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RORCP51449 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RORCP51449 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RORCP51449 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RORCP51449 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RORCP51449 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RORCP51449 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RORCP51449 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RORCP51449 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RORCP51449 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RORCP51449 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RORCP51449 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RORCP51449 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RORCP51449 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RORCP51449 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RORCP51449 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RORCP51449 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RORCP51449 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RORCP51449 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RORCP51449 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RORCP51449 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RORCP51449 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RORCP51449 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RORCP51449 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RORCP51449 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RORCP51449 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RORCP51449 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RORCP51449 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RORCP51449 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RORCP51449 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RORCP51449 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RORCP51449 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RORCP51449 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RORCP51449 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RORCP51449 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RORCP51449 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RORCP51449 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RORCP51449 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RORCP51449 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RORCP51449 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RORCP51449 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RORCP51449 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RORCP51449 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RORCP51449 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RORCP51449 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RORCP51449 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RORCP51449 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RORCP51449 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RORCP51449 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RORCP51449 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RORCP51449 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RORCP51449 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RORCP51449 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RORCP51449 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RORCP51449 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RORCP51449 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RORCP51449 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RORCP51449 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RORCP51449 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RORCP51449 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RORCP51449 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RORCP51449 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RORCP51449 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RORCP51449 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RORCP51449 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RORCP51449 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RORCP51449 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RORCP51449 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RORCP51449 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RORCP51449 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RORCP51449 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RORCP51449 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RORCP51449 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RORCP51449 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RORCP51449 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RORCP51449 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RORCP51449 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RORCP51449 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RORCP51449 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RORCP51449 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RORCP51449 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RORCP51449 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RORCP51449 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RORCP51449 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RORCP51449 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RORCP51449 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RORCP51449 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms