Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERFP50548 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERFP50548 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERFP50548 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERFP50548 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERFP50548 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERFP50548 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
ERFP50548 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
ERFP50548 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
ERFP50548 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERFP50548 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERFP50548 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERFP50548 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERFP50548 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERFP50548 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERFP50548 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERFP50548 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERFP50548 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERFP50548 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERFP50548 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERFP50548 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERFP50548 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERFP50548 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERFP50548 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERFP50548 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERFP50548 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERFP50548 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERFP50548 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERFP50548 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERFP50548 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERFP50548 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
ERFP50548 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERFP50548 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERFP50548 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERFP50548 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERFP50548 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERFP50548 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERFP50548 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERFP50548 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERFP50548 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERFP50548 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERFP50548 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERFP50548 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERFP50548 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERFP50548 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERFP50548 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
ERFP50548 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERFP50548 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERFP50548 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERFP50548 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERFP50548 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERFP50548 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERFP50548 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERFP50548 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERFP50548 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERFP50548 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERFP50548 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERFP50548 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ERFP50548 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERFP50548 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ERFP50548 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERFP50548 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERFP50548 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERFP50548 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERFP50548 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ERFP50548 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERFP50548 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERFP50548 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERFP50548 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ERFP50548 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ERFP50548 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERFP50548 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERFP50548 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERFP50548 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERFP50548 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERFP50548 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERFP50548 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERFP50548 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERFP50548 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERFP50548 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERFP50548 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERFP50548 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERFP50548 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERFP50548 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERFP50548 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERFP50548 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERFP50548 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERFP50548 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ERFP50548 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERFP50548 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERFP50548 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERFP50548 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERFP50548 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ERFP50548 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERFP50548 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERFP50548 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERFP50548 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERFP50548 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERFP50548 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ERFP50548 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms