Protein–RNA interactions for Protein: P49840

GSK3A, Glycogen synthase kinase-3 alpha, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3AP49840 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GSK3AP49840 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GSK3AP49840 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GSK3AP49840 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
GSK3AP49840 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GSK3AP49840 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GSK3AP49840 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GSK3AP49840 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
GSK3AP49840 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GSK3AP49840 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GSK3AP49840 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GSK3AP49840 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GSK3AP49840 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GSK3AP49840 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GSK3AP49840 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GSK3AP49840 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GSK3AP49840 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GSK3AP49840 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GSK3AP49840 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GSK3AP49840 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GSK3AP49840 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GSK3AP49840 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GSK3AP49840 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GSK3AP49840 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GSK3AP49840 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GSK3AP49840 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GSK3AP49840 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GSK3AP49840 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GSK3AP49840 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GSK3AP49840 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GSK3AP49840 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GSK3AP49840 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GSK3AP49840 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GSK3AP49840 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GSK3AP49840 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GSK3AP49840 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GSK3AP49840 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GSK3AP49840 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GSK3AP49840 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GSK3AP49840 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GSK3AP49840 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GSK3AP49840 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GSK3AP49840 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GSK3AP49840 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GSK3AP49840 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GSK3AP49840 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GSK3AP49840 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GSK3AP49840 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GSK3AP49840 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GSK3AP49840 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GSK3AP49840 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GSK3AP49840 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
GSK3AP49840 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GSK3AP49840 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GSK3AP49840 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GSK3AP49840 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GSK3AP49840 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GSK3AP49840 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GSK3AP49840 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GSK3AP49840 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GSK3AP49840 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GSK3AP49840 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GSK3AP49840 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GSK3AP49840 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GSK3AP49840 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GSK3AP49840 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GSK3AP49840 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GSK3AP49840 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GSK3AP49840 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GSK3AP49840 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GSK3AP49840 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GSK3AP49840 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GSK3AP49840 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GSK3AP49840 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GSK3AP49840 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GSK3AP49840 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GSK3AP49840 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GSK3AP49840 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GSK3AP49840 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GSK3AP49840 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GSK3AP49840 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GSK3AP49840 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GSK3AP49840 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GSK3AP49840 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GSK3AP49840 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
GSK3AP49840 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GSK3AP49840 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
GSK3AP49840 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GSK3AP49840 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
GSK3AP49840 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.02■□□□□ -0
GSK3AP49840 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
GSK3AP49840 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GSK3AP49840 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
GSK3AP49840 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
GSK3AP49840 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GSK3AP49840 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
GSK3AP49840 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
GSK3AP49840 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
GSK3AP49840 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
GSK3AP49840 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms