Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GCLMP48507 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GCLMP48507 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GCLMP48507 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GCLMP48507 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GCLMP48507 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GCLMP48507 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GCLMP48507 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GCLMP48507 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GCLMP48507 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GCLMP48507 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GCLMP48507 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GCLMP48507 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GCLMP48507 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GCLMP48507 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GCLMP48507 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GCLMP48507 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GCLMP48507 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GCLMP48507 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GCLMP48507 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GCLMP48507 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GCLMP48507 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GCLMP48507 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GCLMP48507 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GCLMP48507 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
GCLMP48507 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GCLMP48507 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GCLMP48507 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GCLMP48507 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GCLMP48507 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GCLMP48507 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GCLMP48507 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GCLMP48507 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GCLMP48507 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GCLMP48507 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GCLMP48507 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GCLMP48507 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GCLMP48507 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GCLMP48507 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GCLMP48507 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GCLMP48507 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GCLMP48507 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
GCLMP48507 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GCLMP48507 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GCLMP48507 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GCLMP48507 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GCLMP48507 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GCLMP48507 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GCLMP48507 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GCLMP48507 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GCLMP48507 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GCLMP48507 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GCLMP48507 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GCLMP48507 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GCLMP48507 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GCLMP48507 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GCLMP48507 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GCLMP48507 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
GCLMP48507 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GCLMP48507 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GCLMP48507 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GCLMP48507 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GCLMP48507 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GCLMP48507 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GCLMP48507 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
GCLMP48507 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GCLMP48507 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GCLMP48507 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GCLMP48507 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GCLMP48507 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
GCLMP48507 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
GCLMP48507 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GCLMP48507 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GCLMP48507 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GCLMP48507 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GCLMP48507 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
GCLMP48507 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GCLMP48507 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GCLMP48507 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GCLMP48507 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GCLMP48507 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GCLMP48507 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GCLMP48507 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GCLMP48507 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GCLMP48507 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GCLMP48507 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GCLMP48507 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GCLMP48507 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCLMP48507 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCLMP48507 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCLMP48507 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
GCLMP48507 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCLMP48507 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCLMP48507 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCLMP48507 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCLMP48507 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCLMP48507 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCLMP48507 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCLMP48507 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
GCLMP48507 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms