Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIA4P48058 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIA4P48058 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIA4P48058 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIA4P48058 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIA4P48058 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIA4P48058 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIA4P48058 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIA4P48058 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GRIA4P48058 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIA4P48058 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIA4P48058 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIA4P48058 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIA4P48058 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIA4P48058 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIA4P48058 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIA4P48058 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIA4P48058 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIA4P48058 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIA4P48058 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIA4P48058 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIA4P48058 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIA4P48058 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIA4P48058 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIA4P48058 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIA4P48058 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIA4P48058 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIA4P48058 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIA4P48058 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIA4P48058 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIA4P48058 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIA4P48058 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIA4P48058 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIA4P48058 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIA4P48058 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIA4P48058 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIA4P48058 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIA4P48058 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIA4P48058 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIA4P48058 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIA4P48058 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GRIA4P48058 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIA4P48058 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIA4P48058 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIA4P48058 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIA4P48058 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIA4P48058 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIA4P48058 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIA4P48058 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIA4P48058 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIA4P48058 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIA4P48058 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIA4P48058 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIA4P48058 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIA4P48058 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIA4P48058 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIA4P48058 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIA4P48058 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIA4P48058 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIA4P48058 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIA4P48058 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIA4P48058 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIA4P48058 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIA4P48058 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIA4P48058 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIA4P48058 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIA4P48058 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIA4P48058 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIA4P48058 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIA4P48058 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIA4P48058 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIA4P48058 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIA4P48058 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIA4P48058 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIA4P48058 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIA4P48058 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIA4P48058 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIA4P48058 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIA4P48058 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIA4P48058 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIA4P48058 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIA4P48058 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
GRIA4P48058 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIA4P48058 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIA4P48058 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIA4P48058 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIA4P48058 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIA4P48058 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIA4P48058 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIA4P48058 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIA4P48058 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIA4P48058 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIA4P48058 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIA4P48058 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIA4P48058 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIA4P48058 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIA4P48058 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIA4P48058 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIA4P48058 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
GRIA4P48058 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms